Si es para registrar primero decido cuales son las que extensiones que registraré si están libres, como paso inmediatamente anterior al registro. De este modo no dejo pasar ni 5 minutos entre chequear y registrar, de otra forma pueden espiar tu whois y registrártelos.
Como herramienta lo mejor es la del propio registrador, no obstante http://www.whois.sc/nombredominio.ext es buena si se trata de verificar las extensiones libres de algun dominio por otros motivos.