En principio no es duplicación el iframe, es mostrar parte de otra web desde la tuya, no estas copiando el contenido sino mostrando en forma total/parcial desde la url de origen que lo contiene con un código standarizado llamado iframe.
El contenido duplicado es punible de sanción por parte de los buscadores, el iframe no.
Lo que contiene el iframe nunca va ser indexado en la dirección que lo muestra porque simplemente entiende que es un iframe, o sea otra url.
Es absolutamente imposible posicionar a base de contenido con otra dirección.
Si puedes poner contenido dentro de tu url aparte del iframe para que sea indexado y quizá pueda posicionar a base de ese contenido propio, y en lo posible original sino estamos peor por sanción clavada segura.